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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
春运首日掠影：让温暖和健康“一路同行”******
中新网杭州1月7日电(张煜欢)春运首日，杭州地区首趟加开列车G4835次载着600多位旅客从杭州东站出发，向着终点站贵阳北疾驰而去，2023年浙江的春运大幕正式开启。
“医生，我咳嗽七八天了，要不要去医院检查一下？”“医生，我经常咳痰咳不出来，有没有什么办法？”1月6日，在宁波开往广州的k212/K209次列车上，一场特别的健康科普在车厢中开展。浙江大学医学院附属第一医院呼吸内科主任医师陈水芳为旅客现场普及新冠病毒个人防护知识和感染后的应对方法，解答旅客们的现场咨询。
几年前，全国劳动模范、杭州客运段甬广车队党总支书记陈美芳发起了一个“劳模智囊团”，陈水芳正是70位成员中的一员。自2017年起，智囊团就每年为春运平安路助力，他们是浙江省各行各业的劳模专家，旅客有需要的时候能求助智囊团成员来帮助解决实际困难，多年来他们为无数旅客的春运之路保驾护航。
“今年春运，旅客们关心的莫过于个人防护问题。所以我们请医生专家来给旅客进行健康讲座和现场咨询，让旅客过个舒心年。”陈美芳介绍。
医生向旅客科普健康知识。 周围 摄“乘上这趟火车，我感觉年味回来了，很温暖，健康知识也很贴心。可能这就是久违的春运氛围吧。”来自广东的邓先生说。
在春运路上，杭州客运段的多趟列车贴起了窗花，挂上了串串灯笼，为旅客送去春联和福字。在杭州西开往武汉的G594次列车上，杭州客运段的乘务员们为前来乘车的旅客送上了健康、平安、福字的三个“大礼包”，车厢中不仅有知名律师团队为旅客讲解防诈骗的法律知识咨询讲座，还有急救志愿者开展海姆立克急救法等急救知识的科普。
“平时最怕的就是小孩子吃东西噎到了，今天在高铁上学到了海姆立克急救法，老师还给我们做了示范，我认真地学习了，觉得还是很需要的。”带着孩子出行的旅客夏女士说。
在上海虹桥开往长沙南的G586次列车上，乘务员给乘车的小旅客们送上了一份小礼物——秋梨膏棒棒糖。
“前两年我们没回家过年，今年赶着春运第一天回家，本以为一个人带娃会很慌乱，没想到乘务员还挺有招。孩子为了拥有棒棒糖，一路上都很听话，让我特别省心，这个‘哄娃神器’太甜太暖心了。”带孩子回武汉过年的张女士说。
“每逢春运，车厢里面小朋友很多，如何让小旅客在长途旅行中不无聊又不吵闹是一大问题。我们想到冬季是容易感冒咳嗽的季节，于是我们为小朋友们特意准备了带有卡通图案的秋梨膏棒棒糖，一方面有益身体健康，另一方面可以让‘小调皮’变成乖宝宝。”杭州客运段列车长姜妹影说。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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